ここではjQueryでチェックボックスを全選択、解除する方法を解説しています。

Script

$(function() {
    $('#all').click(function() {
        if (this.checked) {
            $('[name="deleteId[]"]').prop('checked', $(this).is(':checked'));
        }
        else {
            $('[name="deleteId[]"]').removeAttr('checked');
        }
    });
});

html

<form action="<?php echo $_SERVER['PHP_SELF'];?>" name="checktest" id="checktest" method="post">
<input type="checkbox" id="all">全選択／全解除<br />
<input type="checkbox" name="deleteId[]" id="deleteId" value="1"><br />
<input type="checkbox" name="deleteId[]" id="deleteId" value="2"><br />
<input type="checkbox" name="deleteId[]" id="deleteId" value="3"><br />
</form>

解説
「this.checked」と記述するとセレクタで指定したチェックボックスが選択されているかがわかるので、処理を分けています。